U toku standardnog Reiki-tretmana terapeut, koji nakon određene unutrašnje pripreme otvori svoj energetski kanal, sprovodi Reiki energiju kroz svoje ruke u energetski sistem primaoca. Ruke se polažu na odredjene tačke tela ili ostaju malo odmaknute od njega. Ruke se na ovim položajima drže po nekoliko minuta, sve dok Reiki energija protiče kroz njih.
Telo osobe koja prima Reiki se pri tome moze uporediti sa sunđerom koji upija onoliko "vode" koliko mu je u određenom trenutku i određenom predelu potrebno. Pri tome terapeut oseća ovaj tok energije i menja položaje ruku tek kada se on prekine. Kompletan Reiki tretman traje oko sat vremena. U određenim situacijama može i jedan skraćeni tj. ciljani tretman dati izvanredne rezultate- kod napetosti, stresa, bolova, povreda, uboda insekata, itd.